Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc9bA3KGF9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms