Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Palm3A2TJV2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms