Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms