Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms