Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scn3aA2ASI5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scn3aA2ASI5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms