Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1A2ANU3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms