Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabreA2AMW3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms