Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Frmpd1A2AKB4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms