Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34dA2AGU5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34dA2AGU5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms