Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc163A2AGD7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms