Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2dnl1A2AFH1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms