Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprfA2A8L5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprfA2A8L5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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