Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms