Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trav12-2A0N8N6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms