Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms