Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms