Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms