Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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