Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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