Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm17190V9GX38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm17190V9GX38 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17190V9GX38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17190V9GX38 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17190V9GX38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17190V9GX38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms