Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl1Q9JI74 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl1Q9JI74 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl1Q9JI74 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl1Q9JI74 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl1Q9JI74 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl1Q9JI74 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl1Q9JI74 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl1Q9JI74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl1Q9JI74 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl1Q9JI74 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl1Q9JI74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl1Q9JI74 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl1Q9JI74 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl1Q9JI74 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl1Q9JI74 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl1Q9JI74 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl1Q9JI74 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl1Q9JI74 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl1Q9JI74 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl1Q9JI74 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl1Q9JI74 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl1Q9JI74 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl1Q9JI74 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl1Q9JI74 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl1Q9JI74 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl1Q9JI74 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl1Q9JI74 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl1Q9JI74 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms