Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Chmp4bQ9D8B3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Chmp4bQ9D8B3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Chmp4bQ9D8B3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Chmp4bQ9D8B3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Chmp4bQ9D8B3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Chmp4bQ9D8B3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Chmp4bQ9D8B3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Chmp4bQ9D8B3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Chmp4bQ9D8B3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Chmp4bQ9D8B3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Chmp4bQ9D8B3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Chmp4bQ9D8B3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Chmp4bQ9D8B3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Chmp4bQ9D8B3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Chmp4bQ9D8B3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Chmp4bQ9D8B3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Chmp4bQ9D8B3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Chmp4bQ9D8B3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chmp4bQ9D8B3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Chmp4bQ9D8B3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chmp4bQ9D8B3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Chmp4bQ9D8B3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Chmp4bQ9D8B3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chmp4bQ9D8B3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chmp4bQ9D8B3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chmp4bQ9D8B3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms