Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbdc1Q9D0B6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbdc1Q9D0B6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbdc1Q9D0B6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbdc1Q9D0B6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbdc1Q9D0B6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbdc1Q9D0B6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbdc1Q9D0B6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pbdc1Q9D0B6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbdc1Q9D0B6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbdc1Q9D0B6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbdc1Q9D0B6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms