Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc47Q9D024 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc47Q9D024 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc47Q9D024 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc47Q9D024 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc47Q9D024 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc47Q9D024 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc47Q9D024 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc47Q9D024 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc47Q9D024 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc47Q9D024 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc47Q9D024 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc47Q9D024 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc47Q9D024 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc47Q9D024 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc47Q9D024 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc47Q9D024 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc47Q9D024 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
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