Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTRAFQ9CQE8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTRAFQ9CQE8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTRAFQ9CQE8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTRAFQ9CQE8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTRAFQ9CQE8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTRAFQ9CQE8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTRAFQ9CQE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RTRAFQ9CQE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTRAFQ9CQE8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTRAFQ9CQE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTRAFQ9CQE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTRAFQ9CQE8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms