Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp1b2Q9CQD4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp1b2Q9CQD4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp1b2Q9CQD4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chmp1b2Q9CQD4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp1b2Q9CQD4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp1b2Q9CQD4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms