Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx18Q91ZR2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx18Q91ZR2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx18Q91ZR2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx18Q91ZR2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx18Q91ZR2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx18Q91ZR2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx18Q91ZR2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx18Q91ZR2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx18Q91ZR2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx18Q91ZR2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx18Q91ZR2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx18Q91ZR2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx18Q91ZR2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx18Q91ZR2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms