Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha5Q91Y15 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdha5Q91Y15 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdha5Q91Y15 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha5Q91Y15 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha5Q91Y15 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha5Q91Y15 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdha5Q91Y15 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdha5Q91Y15 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdha5Q91Y15 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha5Q91Y15 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha5Q91Y15 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha5Q91Y15 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdha5Q91Y15 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha5Q91Y15 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha5Q91Y15 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcdha5Q91Y15 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms