Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3C0

Rnasek, Ribonuclease kappa, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RnasekQ8K3C0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RnasekQ8K3C0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RnasekQ8K3C0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RnasekQ8K3C0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RnasekQ8K3C0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RnasekQ8K3C0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms