Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot3Q8K0V4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot3Q8K0V4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot3Q8K0V4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot3Q8K0V4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot3Q8K0V4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot3Q8K0V4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot3Q8K0V4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms