Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ep400Q8CHI8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ep400Q8CHI8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ep400Q8CHI8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ep400Q8CHI8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ep400Q8CHI8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ep400Q8CHI8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ep400Q8CHI8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ep400Q8CHI8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ep400Q8CHI8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ep400Q8CHI8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ep400Q8CHI8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ep400Q8CHI8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ep400Q8CHI8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ep400Q8CHI8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ep400Q8CHI8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ep400Q8CHI8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ep400Q8CHI8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ep400Q8CHI8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ep400Q8CHI8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ep400Q8CHI8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ep400Q8CHI8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ep400Q8CHI8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ep400Q8CHI8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ep400Q8CHI8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ep400Q8CHI8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ep400Q8CHI8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ep400Q8CHI8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ep400Q8CHI8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ep400Q8CHI8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ep400Q8CHI8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ep400Q8CHI8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ep400Q8CHI8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ep400Q8CHI8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ep400Q8CHI8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ep400Q8CHI8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ep400Q8CHI8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ep400Q8CHI8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ep400Q8CHI8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ep400Q8CHI8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ep400Q8CHI8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ep400Q8CHI8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ep400Q8CHI8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ep400Q8CHI8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms