Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
Cc2d2aQ8CFW7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Cc2d2aQ8CFW7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Cc2d2aQ8CFW7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Cc2d2aQ8CFW7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Cc2d2aQ8CFW7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
Cc2d2aQ8CFW7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Cc2d2aQ8CFW7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Cc2d2aQ8CFW7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Cc2d2aQ8CFW7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Cc2d2aQ8CFW7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Cc2d2aQ8CFW7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
Cc2d2aQ8CFW7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Cc2d2aQ8CFW7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Cc2d2aQ8CFW7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Cc2d2aQ8CFW7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Cc2d2aQ8CFW7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Cc2d2aQ8CFW7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Cc2d2aQ8CFW7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
Cc2d2aQ8CFW7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Cc2d2aQ8CFW7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
Cc2d2aQ8CFW7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Cc2d2aQ8CFW7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Cc2d2aQ8CFW7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC44.65■■■■■ 4.74
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Cc2d2aQ8CFW7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Cc2d2aQ8CFW7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
Cc2d2aQ8CFW7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
Cc2d2aQ8CFW7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Cc2d2aQ8CFW7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Cc2d2aQ8CFW7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Cc2d2aQ8CFW7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Cc2d2aQ8CFW7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Cc2d2aQ8CFW7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Cc2d2aQ8CFW7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Cc2d2aQ8CFW7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Cc2d2aQ8CFW7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Cc2d2aQ8CFW7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Cc2d2aQ8CFW7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Cc2d2aQ8CFW7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Cc2d2aQ8CFW7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Cc2d2aQ8CFW7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Cc2d2aQ8CFW7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Cc2d2aQ8CFW7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Cc2d2aQ8CFW7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
Cc2d2aQ8CFW7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Cc2d2aQ8CFW7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Cc2d2aQ8CFW7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
Cc2d2aQ8CFW7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Cc2d2aQ8CFW7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Cc2d2aQ8CFW7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Cc2d2aQ8CFW7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms