Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q8CF25 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q8CF25 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q8CF25 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q8CF25 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8CF25 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8CF25 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8CF25 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8CF25 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8CF25 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8CF25 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q8CF25 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q8CF25 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8CF25 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8CF25 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8CF25 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8CF25 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8CF25 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8CF25 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8CF25 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q8CF25 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Q8CF25 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8CF25 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8CF25 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8CF25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8CF25 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8CF25 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8CF25 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8CF25 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8CF25 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8CF25 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8CF25 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8CF25 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8CF25 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8CF25 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8CF25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8CF25 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8CF25 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8CF25 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8CF25 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8CF25 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8CF25 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8CF25 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8CF25 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8CF25 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8CF25 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8CF25 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8CF25 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8CF25 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8CF25 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8CF25 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8CF25 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8CF25 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8CF25 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8CF25 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8CF25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8CF25 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8CF25 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8CF25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8CF25 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8CF25 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8CF25 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8CF25 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8CF25 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8CF25 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8CF25 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8CF25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8CF25 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8CF25 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8CF25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8CF25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8CF25 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8CF25 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8CF25 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q8CF25 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8CF25 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q8CF25 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8CF25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8CF25 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8CF25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8CF25 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q8CF25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8CF25 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8CF25 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8CF25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8CF25 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q8CF25 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8CF25 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8CF25 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8CF25 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q8CF25 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8CF25 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8CF25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q8CF25 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8CF25 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q8CF25 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CF25 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CF25 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q8CF25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q8CF25 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms