Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BC106179Q8C9L1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC106179Q8C9L1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC106179Q8C9L1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC106179Q8C9L1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC106179Q8C9L1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms