Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcl3Q8BVF2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdcl3Q8BVF2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdcl3Q8BVF2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcl3Q8BVF2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcl3Q8BVF2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcl3Q8BVF2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdcl3Q8BVF2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms