Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EpopQ7TNS8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EpopQ7TNS8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EpopQ7TNS8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EpopQ7TNS8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EpopQ7TNS8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EpopQ7TNS8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EpopQ7TNS8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EpopQ7TNS8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EpopQ7TNS8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EpopQ7TNS8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EpopQ7TNS8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EpopQ7TNS8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EpopQ7TNS8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EpopQ7TNS8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EpopQ7TNS8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EpopQ7TNS8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms