Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnip4Q6PHZ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnip4Q6PHZ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnip4Q6PHZ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnip4Q6PHZ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnip4Q6PHZ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnip4Q6PHZ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnip4Q6PHZ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnip4Q6PHZ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms