Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN3

Dclk2, Serine/threonine-protein kinase DCLK2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk2Q6PGN3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Dclk2Q6PGN3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Dclk2Q6PGN3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Dclk2Q6PGN3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Dclk2Q6PGN3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Dclk2Q6PGN3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Dclk2Q6PGN3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Dclk2Q6PGN3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Dclk2Q6PGN3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Dclk2Q6PGN3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Dclk2Q6PGN3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,1 ms