Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN3

Dclk2, Serine/threonine-protein kinase DCLK2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk2Q6PGN3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dclk2Q6PGN3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dclk2Q6PGN3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dclk2Q6PGN3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dclk2Q6PGN3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclk2Q6PGN3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk2Q6PGN3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dclk2Q6PGN3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dclk2Q6PGN3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclk2Q6PGN3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclk2Q6PGN3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms