Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Ptpdc1Q6NZK8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ptpdc1Q6NZK8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,38■■■□□ 2,45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Ptpdc1Q6NZK8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Ptpdc1Q6NZK8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Ptpdc1Q6NZK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Ptpdc1Q6NZK8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Ptpdc1Q6NZK8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Ptpdc1Q6NZK8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30,24■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ptpdc1Q6NZK8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ptpdc1Q6NZK8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ptpdc1Q6NZK8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ptpdc1Q6NZK8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ptpdc1Q6NZK8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ptpdc1Q6NZK8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Ptpdc1Q6NZK8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Ptpdc1Q6NZK8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ptpdc1Q6NZK8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ptpdc1Q6NZK8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ptpdc1Q6NZK8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Ptpdc1Q6NZK8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ptpdc1Q6NZK8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Ptpdc1Q6NZK8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Ptpdc1Q6NZK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ptpdc1Q6NZK8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ptpdc1Q6NZK8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ptpdc1Q6NZK8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Ptpdc1Q6NZK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ptpdc1Q6NZK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms