Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttf1Q62187 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttf1Q62187 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttf1Q62187 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttf1Q62187 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttf1Q62187 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ttf1Q62187 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttf1Q62187 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttf1Q62187 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttf1Q62187 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttf1Q62187 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms