Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd53Q61451 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd53Q61451 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd53Q61451 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd53Q61451 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd53Q61451 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd53Q61451 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd53Q61451 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms