Protein–RNA interactions for Protein: Q61234

Snta1, Alpha-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snta1Q61234 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snta1Q61234 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snta1Q61234 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snta1Q61234 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snta1Q61234 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snta1Q61234 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snta1Q61234 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snta1Q61234 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snta1Q61234 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms