Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpc6Q61143 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpc6Q61143 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpc6Q61143 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpc6Q61143 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpc6Q61143 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpc6Q61143 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpc6Q61143 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpc6Q61143 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpc6Q61143 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpc6Q61143 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpc6Q61143 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpc6Q61143 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpc6Q61143 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpc6Q61143 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpc6Q61143 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpc6Q61143 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpc6Q61143 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc6Q61143 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc6Q61143 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trpc6Q61143 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.52■■■□□ 2
Trpc6Q61143 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpc6Q61143 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpc6Q61143 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpc6Q61143 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpc6Q61143 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpc6Q61143 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpc6Q61143 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpc6Q61143 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpc6Q61143 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc6Q61143 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc6Q61143 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc6Q61143 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms