Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctf1Q60753 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctf1Q60753 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctf1Q60753 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctf1Q60753 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctf1Q60753 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctf1Q60753 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctf1Q60753 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctf1Q60753 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctf1Q60753 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctf1Q60753 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctf1Q60753 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctf1Q60753 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms