Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim15Q3UTD9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smim15Q3UTD9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim15Q3UTD9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim15Q3UTD9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim15Q3UTD9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim15Q3UTD9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms