Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
RubcnlQ3TD16 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
RubcnlQ3TD16 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
RubcnlQ3TD16 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
RubcnlQ3TD16 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
RubcnlQ3TD16 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
RubcnlQ3TD16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
RubcnlQ3TD16 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,49■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,48■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,47■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
RubcnlQ3TD16 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
RubcnlQ3TD16 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
RubcnlQ3TD16 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
RubcnlQ3TD16 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
RubcnlQ3TD16 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
RubcnlQ3TD16 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
RubcnlQ3TD16 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
RubcnlQ3TD16 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
RubcnlQ3TD16 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
RubcnlQ3TD16 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
RubcnlQ3TD16 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
RubcnlQ3TD16 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
RubcnlQ3TD16 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
RubcnlQ3TD16 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
RubcnlQ3TD16 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
RubcnlQ3TD16 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,35■■■□□ 2,29
RubcnlQ3TD16 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,33■■■□□ 2,29
RubcnlQ3TD16 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
RubcnlQ3TD16 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
RubcnlQ3TD16 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,19■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,16■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,14■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,26
RubcnlQ3TD16 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
RubcnlQ3TD16 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
RubcnlQ3TD16 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
RubcnlQ3TD16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
RubcnlQ3TD16 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms