Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp8Q2V6D6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp8Q2V6D6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms