Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp8Q2V6D6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp8Q2V6D6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp8Q2V6D6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp8Q2V6D6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp8Q2V6D6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp8Q2V6D6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp8Q2V6D6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp8Q2V6D6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp8Q2V6D6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms