Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Thbs3Q05895 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Thbs3Q05895 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Thbs3Q05895 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Thbs3Q05895 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Thbs3Q05895 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Thbs3Q05895 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21,83■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21,8■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Thbs3Q05895 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,75■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Thbs3Q05895 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21,66■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21,65■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,06
Thbs3Q05895 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Thbs3Q05895 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Thbs3Q05895 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21,5■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,03
Thbs3Q05895 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Thbs3Q05895 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Thbs3Q05895 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Thbs3Q05895 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,1 ms