Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Serpina1eQ00898 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Serpina1eQ00898 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Serpina1eQ00898 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Serpina1eQ00898 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Serpina1eQ00898 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Serpina1eQ00898 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Serpina1eQ00898 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Serpina1eQ00898 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Serpina1eQ00898 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Serpina1eQ00898 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Serpina1eQ00898 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Serpina1eQ00898 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Serpina1eQ00898 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Serpina1eQ00898 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpina1eQ00898 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpina1eQ00898 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Serpina1eQ00898 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Serpina1eQ00898 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms