Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cited1P97769 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited1P97769 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited1P97769 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited1P97769 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cited1P97769 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cited1P97769 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cited1P97769 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cited1P97769 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cited1P97769 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cited1P97769 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cited1P97769 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited1P97769 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cited1P97769 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cited1P97769 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cited1P97769 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cited1P97769 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cited1P97769 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cited1P97769 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited1P97769 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cited1P97769 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cited1P97769 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited1P97769 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms